唐飛院黨總支書記、院長
主持全院工作。分管：《四川文物》編輯部
姚軍院黨總支委員、副院長
分管：人事科、文化遺產保護研究所、四川石窟寺保護研究院（石窟寺考古研究所）、文物信息中心、國際交流中心
劉祿山院黨總支委員、副院長
分管：財務科、黨群辦、革命文物保護研究中心
謝振斌副院長
分管：辦公室、業務管理辦公室、四川石窟寺保護研究院（石窟寺保護工程研究所）、文物保護修復研究中心
劉志巖副院長
分管：科研管理辦公室、三星堆考古研究所、舊石器考古研究所、新石器考古研究所、商周考古研究所、歷史時期考古研究所、民族考古研究中心、 科技考古中心、皮洛遺址工作站、城壩遺址工作站、羅家壩遺址工作站、江口遺址工作站、會理考古工作站、廣元考古工作站